目前，脑积水常用的手术方法分为置管分流手术和神经内镜手术，两者在脑积水治疗上均发挥重要的作用。
置管分流术
但置管分流术因植入物带来诸多弊端，如分流管阻塞和位置不当、感染、分流过度和分流管依赖等。虽然目前分流管制作工艺有了很大提高，出现了可调压分流管和抗感染分流管，但上述问题仍无法彻底解决。
神经内镜手术
脑室镜下第三脑室底造瘘术可以避免分流管植入以及相关的并发症，手术方式符合人体脑脊液循环的生理特点，术后并发症的发生率相对较低，目前正逐渐取代置管分流手术而成为治疗梗阻性脑积水的首选。
脑室镜下ETV作为非植入性及侵入性较低的方法，在脑积水的治疗中已获得良好的疗效。但脑室镜手术也有其局限性，近期总体的成功率没有置管分流手术高，尤其是婴幼儿脑积水、出血及炎性反应等原因引起的脑积水。ETV的成功率主要与病因、年龄、解剖因素、手术方法及术者的手术经验等有着密不可分的联系，其中病因和年龄是最主要的影响因素。
婴幼儿脑积水手术选择应考虑其特殊性
婴幼儿尤其是1岁的婴儿，脑组织处于快速发育阶段，在脑室严重扩大的情况下，持续的颅内高压会造成神经发育不良，脑积水的及早治疗可以使脑功能恢复，而晚期则失去了脑功能恢复的时机。表明在这个关键阶段之前治疗能够使神经发育恢复正常。
但考虑到婴幼儿脑组织发育的特殊性，脑室镜手术选择需要慎重，手术指征要严格把握，术前疗效的准确预判显得尤为重要。
软性内镜在脑积水诊断和治疗中的应用
目前，我国脑室镜治疗脑积水的水平和国外不相上下，尤其是在几个大的神经内镜诊治中心。随着医学的发展，一种新型的疏通脑脊液循环通路梗阻的工具——软性神经内镜已经成功应用于脑积水的临床治疗中。
其直径仅有3.8mm，相当于筷子粗细。由于其柔软、纤细、灵活的特性，通过头部一个3cm左右的小切口即可对脑脊液循环通路进行更广范围的疏通，在脑积水的诊断和治疗中有其独特优势，创伤更小，恢复更快，效果更佳，且费用低廉，又避免了分流术后的各种并发症。
在诊断方面，软性内镜下可以对整个脑室系统包括第四脑室进行全面探查，对脑积水的病因判断更为确切。
在治疗方面，首先可以根据脑室探查结果，对有出血、感染的脑室进行内镜下洗脑手术对脑室内的“脏物”进行彻底清除；其次，对有明确梗阻的脑积水可以进行个性化疏通，包括导水管成形、第四脑室流出道疏通等，使脑脊液恢复正常的生理循环。确实疏通困难者可通过第三脑室造瘘进行脑室内旁路手术。软性内镜下第三脑室造瘘其瘘口位置选择更为灵活，除最常见的第三脑室底外，还可向前选择终板造瘘或向后选择第三脑室-小脑上池造瘘。另外，软性内镜下还可通过辅助脉络丛烧灼来减少脑脊液分泌以治疗难治性脑积水，软性内镜下可通过一个切口对双侧侧脑室及第四脑室内的脉络丛进行烧灼，效果更确切。
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