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浅谈mNGS技术的应用现状与前景

浅谈mNGS技术的应用现状与前景

供稿人:冯帅飞整理编辑:谢许茵

摘要

自然界中存在多种多样的微生物,是一个巨大的具有遗传多样性的世界。虽然一部分微生物对动物的健康是有益的,但是仍有一部分微生物,特别是病毒,会对动物甚至人类的健康产生巨大的威胁,并且这部分成员大多是不可培养的微生物。临床宏基因组学二代测序技术(mNGS)是对患者样本中微生物和宿主遗传物质(DNA和RNA)综合分析的新兴技术,正迅速从研究进入临床实验室。这种方法应用范围十分广泛,包括抗菌素耐药性、微生物群、人类宿主基因表达(转录组)和肿瘤学,正在逐渐改变医生诊断和治疗传染病的方式。本综述主要是对mNGS的发展历史,临床运用进展以及优劣势的评估和使用方法等进行简述。

关键词:宏基因组学;mNGS;传染病;病原微生物;高通量测序

引言

年,新型冠状病毒(-nCoV)引起的肺炎迅速席卷整个世界,截至于年7月全球感染总数已经达到了千万人以上,更有50多万人因此而丧生。WHO于年1月30日宣布将新型冠状病毒疫情列为国际

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