手术可分为病因治疗、减少脑脊液生成及脑脊液分流术三种。发现脑积水后应尽早手术，晚期因大脑皮质萎缩或出现严重神经功能障碍，手术效果较差。
在80年代以前，对脑积水的治疗是一个非常棘手的问题，脑积水的患者有着极高的死亡率及致残率，早期的分流手术，也有极高的并发症。近些年来，随着科技的发展，对脑积水的治疗出现了许多的新方法，不同机理分流阀门的出现，神经内镜技术的发展，许多患者通过有效的治疗得到痊愈，并恢复正常生活和工作。
（一）、病因治疗（根治性方法）
病因治疗应成为治疗脑积水的首选方法。对阻塞性脑积水来说，解除梗阻是最理想的方法。如室间孔穿通术、导水管重建术、第四脑室囊肿造瘘术、脑室内肿瘤切除术、第三脑室底造瘘术、枕大孔减压术等。采用病因治疗方法，手术一旦成功，患者可以终生受益。近年来，神经内镜下的室间孔穿通术、神经内镜下导水管重建术、神经内镜下第三脑室底造瘘术等方法进行脑积水治疗，已成为脑积水治疗最有效、最安全的微创方法，手术的并发症小于5％，是目前在国内唯一、世界上少数几个能够开展导水管成形及支架植入术治疗梗阻性脑积水的单位。
第三脑室底造瘘术的利与弊
§1）脑室镜手术的适应症：
§梗阻性脑积水
§部分交通性脑积水
§炎症性脑积水？
§出血性脑积水？
§不同类型脑积水的效果：脑肿瘤90%，导水管梗阻80%，交通性脑积水50%，脑出血脑积水40%，脑炎性脑积水30%
§先天性脑积水最佳治疗年龄：
§（1）任何年龄尤以1.5岁以上较好（2）小于6个月有效但造瘘口易闭合
2）婴幼儿脑积水脑室镜手术适合目前国情吗？
§内因：年龄小家属不愿承担风险，可能错过最佳治疗时机，可能错过最佳治疗时机
§外因：传统概念、医疗理念、医疗费支出、医疗环境
§脑积水术前检查：脑脊液电影及头部CT、及核磁共振、详细的病史及体检-术前评估-年龄及脑积水程度、类型-慎重选择脑室镜
3）手术指适应症的几个问题
阻塞性脑积水有很好的成功率约70-80%
§交通性脑积水，以及小于1岁的婴幼儿成功率很低，手术需慎重
§对于存在有病理性改变的病人，成功率也很低，如肿瘤、已经做过分流术的病人、曾有过蛛网膜下腔出血、或有过脑炎以及显著的三脑室底疤痕增生的病人
4）目前发现有些交通性脑积水脑室镜手术也有效
§脑池造影表明脑室内造影剂的排空证是由于脑脊液不能到达吸收的蛛网膜颗粒，原因在于基底池发生梗阻，（基底池梗阻性脑积水）
§CT示四个脑室均扩张（交通性脑积水？）
§可以在未阻塞的脚间池和蛛网膜之间造瘘，
§有时交通性脑积水三脑室造瘘也有效
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