当前，脑脊液分流手术治疗脑积水因其操作简便，医院神经外科广为采用，但对于脑积水的治疗来说，这是没有办法的办法。因为脑脊液本身对脑和脊髓具有营养、支持、保护作用，把脑脊液通过分流管引流到腹腔、胸腔、静脉或心房等部位，无端增加了这些部位的负担，也削弱了脑脊液对神经系统的营养支持和保护作用。况且脑脊液分流手术并发症较多，除终生依赖分流管外，分流管梗阻、感染、移位等均需要反复多次调整分流管，增加患者的痛苦与风险，也给患者及家属带来极大的精神与经济负担。
内镜下治疗渐成首选神经内镜下脑室探查，相当于把神经外科医师的眼睛延伸到脑室内进行实地考察，可以发现头颅CT或磁共振检查难以发现的脑积水病因，并进行针对性治疗。随着神经内镜设备及手术器械的不断改进与完善，手术创伤越来越小，效果越来越好，正逐步被国内外医疗界和患者接受认可，成为脑积水治疗的首选方式。
内镜下第三脑室造瘘术治疗导水管狭窄或后颅窝良性占位性病变引起的脑积水，有效率均可达到85%以上，明显高于其他术式。尤其对小儿脑积水患者来说，随着患儿成长，需要多次进行腹腔分流术，很容易发生并发症且危险性也比较大，而内镜下第三脑室造瘘术在这方面效果要好得多，目前是治疗小儿梗阻性脑积水最为理想的选择。
病因不同应对方法也不同临床上通常根据神经影像学检查所见把脑积水分为交通性脑积水和非交通性脑积水两大类。对于神经影像学检查发现有明确梗阻的脑积水，神经内镜下脑室探查，对梗阻部位进行疏通可以恢复脑脊液的正常循环；神经影像学检查没有发现明确梗阻的交通性脑积水，相当一部分病例是脑组织顺应性下降，脑脊液循环动力不足所致，这种情况通过内镜下第三脑室-脑池造瘘也可改善脑脊液循环，一定程度上缓解脑积水的进展。
在应用神经内镜治疗脑积水时，软性电子内镜与硬质内镜相比具有明显优势，软性电子内镜恰如疏通下水道时所使用的专业工具一样，能够对脑脊液循环通路进行更大范围的探查与疏通，在更小的手术创伤下取得更好的效果。
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